1. 租金支付纠纷：首先，双方当事人应协商解决，如达成一致意见，则可按照协商结果执行。若无法协商一致，可依照租房合同中约定的民事诉讼或申请仲裁解决。在申请仲裁时，应注意双方是否已在合同中约定仲裁方式解决纠纷，否则仲裁委员会可能不予受理。若双方事先未约定仲裁方式，或者事后未达成仲裁协议，可以直接向人民法院提起民事诉讼。

2. 损害赔偿纠纷：这类纠纷主要涉及侵权行为引起的人身或财物损害赔偿、房屋损害赔偿以及侵犯房屋共有人合法权益赔偿等。面对此类纠纷，当事人可通过法律途径积极维权。当事人可以向人民法院提起诉讼，要求对方承担相应的损害赔偿责任。

3. 合同主体“模糊化”：在签订租赁合同时，应认真审查合同主体，明确出租方。如遇到类似情况，应主动向房地产经纪公司提出修改合同主体。在发生纠纷并起诉房地产经纪公司时，应注意诉讼主体是否适格。

4. 格式合同条款权利义务不平等：对于房地产经纪公司提供的格式合同，应注意审查其中的违约责任条款是否过于偏重承租人的责任义务。在签订合同时，可尝试与对方协商调整相关条款，以达到相对公平的状态。

5. 租期约定：对于租期约定方面的纠纷，双方应在签订合同前充分沟通，并在合同中明确约定租期。如遇特殊情况，可根据实际情况协商解决。在履行合同过程中，应保留相关证据，以便在发生纠纷时维护自身权益。

总之，在租房协议中遭遇纠纷时，双方当事人应首先尝试协商解决。若无法协商一致，可根据合同中约定的纠纷解决方式，采取民事诉讼或申请仲裁等方式寻求解决。在签订租赁合同前，应注意审查合同条款，确保自身权益得到充分保障。如有需要，可咨询专业律师以获得更详细的法律建议。